Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ric1Q69ZJ7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms