Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms