Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ptpn13Q64512 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ptpn13Q64512 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms