Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpd52Q62393 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms