Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3cQ62181 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms