Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1aQ61481 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1aQ61481 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1aQ61481 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1aQ61481 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1aQ61481 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms