Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msi1Q61474 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms