Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PcolceQ61398 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PcolceQ61398 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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PcolceQ61398 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PcolceQ61398 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PcolceQ61398 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PcolceQ61398 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PcolceQ61398 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PcolceQ61398 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PcolceQ61398 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PcolceQ61398 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PcolceQ61398 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PcolceQ61398 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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