Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms