Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stxbp3Q60770 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms