Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atf3Q60765 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms