Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mkrn3Q60764 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mkrn3Q60764 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms