Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc27a1Q60714 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms