Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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