Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Xrcc1Q60596 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc1Q60596 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Xrcc1Q60596 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Xrcc1Q60596 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Xrcc1Q60596 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Xrcc1Q60596 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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