Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms