Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc47Q505F5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc47Q505F5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms