Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
R3hdm4Q4VBF2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms