Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc3lQ4KL14 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms