Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lin28bQ45KJ6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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