Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Pacs2Q3V3Q7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pacs2Q3V3Q7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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