Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ckap2Q3V1H1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms