Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc185Q3V118 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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