Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbof1Q3V079 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms