Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9Q3V038 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms