Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Vmn1r-ps128-201ENSMUST00000121211 1739 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Etos1-201ENSMUST00000057134 2015 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm13302-201ENSMUST00000119405 1849 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Il17rd-205ENSMUST00000226105 2923 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm12496-201ENSMUST00000154377 668 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Irx6-202ENSMUST00000167261 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SvipQ3UZP4 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 605.5 ms