Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms