Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms