Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVD5

Lgr6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr6Q3UVD5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgr6Q3UVD5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr6Q3UVD5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms