Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28047Q3US59 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms