Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsponQ3UPR9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms