Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms