Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms