Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc34Q3UI66 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms