Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms