Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Parp8Q3UD82 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Parp8Q3UD82 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms