Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ssbp4Q3U4B1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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