Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms