Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc9Q3U0M1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms