Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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