Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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