Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim43aQ3TL54 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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