Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afvQ3THW5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms