Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hddc2Q3SXD3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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