Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtl9Q32KG4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtl9Q32KG4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl9Q32KG4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl9Q32KG4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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