Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cpne9Q1RLL3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cpne9Q1RLL3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cpne9Q1RLL3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cpne9Q1RLL3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cpne9Q1RLL3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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