Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam171bQ14CH0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms