Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms