Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms