Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms